Rendez-vous Petit-déjeuner "Modules de formation professionnelle Safire / Université de Poitiers"

Publié le 03/11/2010

En collaboration avec l’Université de Poitiers et le Safire, le Biopôle Santé organise un petit déjeuner pour la présentation de modules de formation professionnelle ouverts aux membres du Biopôle.
Le Biopôle Santé vous convie donc le :

Jeudi 18 novembre 2010
de 9h00 à 10h30
au Safire (Université de Poitiers), bât. B25, 2 r. Pierre Brousse 86022 Poitiers

Merci de confirmer votre participation dès maintenant par email : [email protected]

Intervenants : M. Jean-Paul Freycon (SAFIRE - Université de Poitiers) et M. Jean-François Faivre (SFA)
________________________________

L’Université de Poitiers a été sollicitée en 2010 par l’entreprise DANISCO (Dangé-Saint-Romain, 86) pour répondre à un besoin de formation de son personnel. Plusieurs modules de formation, issus de Master existants, ont été proposés à l’entreprise avec la perspective de mise en place des premiers modules en mars 2011. Via le Safire, l’Université de Poitiers saisit l’opportunité de ce projet pour proposer une mutualisation de cette formation avec d’autres entreprises régionales du même secteur d’activité, par l’intermédiaire du Biopôle Santé.
L’inscription aux modules est « à la carte ». La création de modules complémentaires et « sur mesures » est également envisagée sur la base des intérêts soulevés par les membres du Biopôle Santé lors de cette réunion.

Présentation synthétique des modules de formation proposés par l’Université de Poitiers :

• S7-01 – Génomique et outils bioinformatiques
Acquisition des notions de génome, transcriptome, protéome. Acquisition des compétences nécessaires à l'analyse de travaux de recherche originaux publiés dans des revues scientifiques, et à l'utilisation d'outils bioinformatiques dédiés à l'analyse structurale et fonctionnelle des génomes procaryotes et eucaryotes.
• S7-02 – Outils d’interprétation d’images biologiques
Compréhension des principes des techniques d'imagerie utilisées en biologie, ainsi que des principes d'interprétation associées. Cas de l'imagerie en neurophysiologie
• S7-03 – Immunologie cellulaire et moléculaire
Acquérir des connaissances approfondies sur les éléments cellulaires et moléculaires intervenant dans l'établissement de la réponse immunitaire. Comprendre les mécanismes impliqués dans les pathologies du système immunitaire. Utiliser ces connaissances lors d'analyses d'expériences et articles scientifiques dans le domaine. Mise en application en travaux pratiques.
• S7-10 – Messagers chimiques, récepteurs et voies de transduction
Permettre aux étudiants de maîtriser les concepts et méthodologies relatives à l’étude des voies de signalisation ainsi que leurs implications dans des processus physiopathologiques.
• S7-12 – Applications des « omics »
Projet OMICS : Recherche de nouveaux gènes - Mise en évidence d’épissage alternatifs - Microarrays et profilage de tumeur - Clustering de gènes - Analyse de gels 2D - Analyse de complexes macromoléculaires.
• S7-14 – Régulation de l’expression des gènes
Structure des génomes, organisation des gènes et différents niveaux de régulation chez Procaryotes et Eucaryotes. Régulation de l'expression des gènes au niveau chromatinien (eucaryotes). Transcription, facteurs de transcription, régulation de la transcription (procaryotes,eucaryotes, virus). Techniques d'étude de la transcription en biologie moléculaire. Régulation de l'expression des gènes au niveau post-transcriptionnel (eucaryotes). Inactivation chromosomique et empreinte parentale. Traduction, contrôle global, contrôles spécifiques et contrôle qualité; Maturation/stabilité des protéines.
• S7-16 – Biotechnologie appliquée
Transgenèse animale : définition et intérêts de la transgenèse, transgenèse par addition, transgenèse par substitution ou ciblée, autres techniques de transfert et de contrôle de l’expression de gènes, vecteurs de thérapie génique
Bactériologie : Les gènes bactériens - La mutagenèse - L’amélioration des souches industrielles : l’exemple des bactéries lactiques - Étude des bactéries par approche moléculaire
Grandes applications de la transgenèse et génétique végétale : Étude de la fonction d’un gène - Le génie génétique appliqué chez les végétaux - La production d'antigènes et d'anticorps dans les plantes - La production d'enzymes d'intérêt thérapeutique dans les plantes - Les produits anticancéreux.
• S8-01 – Biostatistiques
Rôle de la statistique en biologie/santé. Statistique descriptive. Statistique inférentielle (modèles probabilistes, fluctuations d'échantillonnage, estimation de paramètres, intervalles de confiance). Tests statistiques. Analyse de la variance/Régression. Exemples d'intérêt
• S8-02 – Analyse de données
Sensibiliser les étudiants à la place de l'outil statistique dans la méthodologie à partir de modèles biologiques
Appréhender le contexte d’application des tests statistiques. Approches des outils informatiques adaptés aux statistiques non paramétriques. Choix du test en fonctions de l'échantillonnage expérimental.
• S8-05 – Programmation R
Présentation des différents modules de R, en particulier bioconductor. Structure des données sous R, rudiments de calcul matriciel. Principes de programmation en R. Utilisation de R pour l'analyse des données d'expression génétique, étude de cas concrets.
• S8-08 – Méthodes d’analyse des macromolécules
Ce module a pour but de donner des connaissances avancées sur les méthodes biophysiques modernes utilisées dans le domaine de la Biologie Structurale, Moléculaire et Cellulaire. Les concepts et principes de ces techniques sont explicités et illustrés par de nombreuses applications.
• S8-10 – Bioinformatique et modélisation biologique
Études approfondie de la bioinformatique : algorithmique spécifique, langages et bibliothèques dédiées, modélisation biologique.
• S8-12 – Microorganismes : de la pathogénicité à l'utilisation par l'homme
L'objectif de ce module est d'apporter aux étudiants un ensemble de connaissances permettant de mieux appréhender la place des microorganismes vis-à-vis des activités humaines. Microorganismes indésirables (mécanismes de la pathogénicité bactérienne et de la résistance aux antimicrobiens; maladies virales). Utilisation des microorganismes par l’Homme (biotechnologies et fermentations industrielles ; traitements des déchets). Écologie microbienne (biofilms et communication; microbiologie de l’eau).
• S8-17 – Prolifération, différenciation et mort cellulaire
Ce module a pour finalité d'initier les étudiants aux principes fondamentaux de la biologie cellulaire et moléculaire en leur donnant des connaissances de base de signalisation cellulaire ainsi que les méthodologies associées. Acquérir les notions fondamentales des mécanismes de signalisation impliqués dans le contrôle de la vie de la cellule (de sa croissance, à sa fonction et enfin à sa mort).
• S9-01 – Dynamique et structure des biomembranes et de leurs constituants
Donner une vision approfondie des mécanismes du trafic vésiculaire, de l'adressage des protéines et des lipides et de la mise en place de domaines membranaires spécialisés chez différents modèles d'étude. Les approches méthodologiques utilisées seront développées, en s'appuyant sur plusieurs modèles de pathologie
• S9-06 – Infection et réponse immunitaire de l'hôte
Cette UE correspond à une formation avancée, fondamentale et appliquée, dans le domaine de l’interaction hôte-pathogène et des réactions de défenses immunitaires et inflammatoires induites. Un large panorama de pathogènes (bactéries, virus, champignons, levures) et d’hôtes (protozoaires, crustacés, insectes, mammifères) sera présenté. Les traitements et les mécanismes de résistance seront abordés.
• S9-07 – Les molécules de transduction : des cibles thérapeutiques
Cette UE correspond à une formation avancée, fondamentale et appliquée, dans les domaines de la pharmacologie moléculaire et cellulaire, des mécanismes impliqués dans la transduction du signal, la cytotoxicité. Ces enseignements sont axés sur les applications thérapeutiques les plus actuelles de ces domaines de connaissance et de compétence très appréciés dans l’industrie du médicament.
• S9-17 – Méthodes d'études de la cellule et génomique fonctionnelle
Les enseignements ont pour objectif d’assurer une formation à 1) la pratique de la culture cellulaire animale, 2) l’utilisation des cultures cellulaires dans la recherche et le développement dans le domaine de la santé, 3) l’utilisation d’outils bioinformatiques pour la génomique fonctionnelle.